Masih diletakkannya pendidikan agama dalam konteks pendidikan nasional di Indonesia menandakan bahwa memang agama bagi masyarakat Indonesia adalah suatu hal yang sangat penting, karena itu bangsa Indonesia dikenal dengan bangsa yang religius. Hal ini juga tercermin dalam sila pertama Pancasila. Namun, cita-cita idealitas tersebut terasa kehilangan maknanya, ketika terjadi berbagai macam kekerasan yang sering kali mengatasnamakan agama. Realitas ini kemudian membawa kesimpulan bahwa agama menjadi lahan yang subur bagi tumbuhnya konflik-konflik horizontal antara pemeluk agama di Indonesia. Maka itu, kita sering kali menyaksikan sebuah paradoks-paradoks, di tengah kesemarakan dan gagap gempitanya aktivitas formal keagamaan, pada saat yang sama kita saksikan persoalan radikalisme dan intoleransi dalam kehidupan keagamaan.